Découvert en 1854, le site du Plonjon est classé monument historique le 18 décembre 1923. Les vestiges trouvés révèlent l'existence d'un village préhistorique.
En 1985, un relevé précis, réalisé par l'Université de Genève, dénombre 1620 pieux visibles. Une datation dendrochronologique réalisée sur des pilotis aboutit à une première datation en 914 avant J.-C. : l'époque du Bronze final ! Les dernières estimations font état de 2'000 à 3'000 pieux qui soutenaient les maisons d'un village.
Malheureusement, selon les experts, ce site est condamné à disparaître d'ici à 50 ans en raison des forts courants lors des tempêtes de bise.
En effet, avant l'aménagement des quais, les rives étaient naturelles et larges. De ce fait, les vagues venaient se briser en douceur sur des grèves non aménagées. Alors qu'aujourd'hui, en raison des quais, un courant de retour se crée et augmente inévitablement l'érosion des vestiges préhistoriques immergés.
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